在怀孕35天进行亲子鉴定的话，是不可以的。因为，根据国家有关法律法规，只有在怀孕280天以上，即满足初生婴儿出生至满月的标准，才能进行亲子鉴定。只有能够完成所有的鉴定流程，才能给出准确的亲子鉴定结果。而怀孕35天的母亲可能尚未生产，甚至还没有办理出生登记手续，所以是不可以进行亲子鉴定的。

此外，想要进行亲子鉴定，还要准备一些必要的证件，包括母亲和孩子的身份证、出生证明、户口本等；此外还有一些其他的证件，比如本人的体检报告，本人的缴费凭证等。

怀孕35天可以进行亲子鉴定，但是，在进行这项检测之前，应该确定双方是否满足一定的法律要求，具有必要的条件和资格，满足一定的法律要求之后，再到法院或者合法登记机关，申办亲子鉴定服务。所需要提交的材料大致如下：

1. 亲子关系确认书样本及相关文书； 2. 被鉴定人身份证件及经办人身份证件； 3. 婴儿医诊断证明及怀孕病历等有关资料。

怀孕35天的亲子鉴定一般不会有什么问题，但需要注意的是，如果是超过35周怀孕的母亲，在进行鉴定前，应证明孩子的出生日期，将病历相关文件交给法律保护的监护人，由其代为鉴定，避免出现伦理上的问题。另外，如果某一方拒绝参加亲子鉴定，那么也可以通过鉴定机构拒绝接受申请或者拒绝参加鉴定，但如果拒绝参加鉴定就会导致亲子关系真实性无法证实，加大了遗产和财产纠纷的可能性。