福建省医学科学研究院明正司法鉴定所隶属于福建省医学科学研究院，是在免疫研究所基础上整合发展而来、福建省第一批依托于公益性医学研究机构而设立的法医物证鉴定中心。福建省医学科学研究院免疫研究所于1996年就开始将HLA分型技术用于亲子鉴定，并与福建省高级人民法院合作成功将亲子鉴定技术应用于法庭审理;2000年率先在福建省引进美国ABI基因分析仪将DNA-STR技术用于亲子鉴定;2002年经福建省司法厅批准成立明正司法鉴定所(闽司[2002] 35号;司法鉴定许可证号：350007006)，成为专门面向社会服务的中立性专业司法鉴定机构。